Sylki ja muutokset syljen erityksessä vaikuttavat pitkäaikaissairauksiin. Syljenerityksen väheneminen ja suun kuivuus voivat liittyä pitkäaikaissairauksiin, kuten reumatauteihin (ks. Reuma ja suun terveys), diabetekseen (ks. Diabetes ja suun terveys) ja sylkirauhasten sairauksiin (ks. Sjögrenin oireyhtymä ja suun kuivuus). Myös monet lääkeaineet aiheuttavat suun kuivuutta ja lisäävät suun alueen vaivoja (taulukko Suun terveys ja lääkkeet).

Suun tulehdukselliset sairaudet (ks. Hampaan kiinnityskudostulehdus (parodontiitti) ja Suun sienitulehdukset) voivat estää tai hidastaa eräiden sairauksien paranemista. Ennen syöpähoitoja ja niiden jälkeen on suun terveydestä pidettävä erityistä huolta (ks. Leukemia ja suun terveys ja Syöpäkasvaimet ja suun terveys). Toisaalta monet sairaudet – esimerkiksi diabetes, sydänsairaudet (ks. Kohonnut verenpaine ja suun terveys ja Sepelvaltimotauti ja suun terveys), astma (ks. Astma ja suun terveys), reuma ja syömishäiriöt (ks. Syömishäiriöt ja suun terveys) – ja niihin liittyvät hoidot voivat heikentää suun terveyttä. Masentuneilla (ks. Psyykkiset sairaudet ja suun terveys) ja erityisesti muistisairailla henkilöillä (ks. Muistisairaudet ja suun terveys) suun hoito saattaa unohtua muiden sairauksien ja ongelmien vuoksi. Moniammatillinen yhteistyö eri terveydenhuollon toimijoiden välillä on tärkeää suun terveyden ylläpidossa.