Normaalimikrobisto ja mikrobiomi

Iho, samoin kuin limakalvot suussa ja koko ruoansulatuskanavassa, hengitysteissä ja sukupuolielimissä, on elimistön rajapinta ympäristöön. Näitä rajapintoja asuttavat lukuisat pieneliöt eli mikrobit: bakteerit, arkeonit, sienet ja virukset, joita kutsutaan ihon ja limakalvojen normaalimikrobistoksi eli normaaliflooraksi.

Normaalimikrobiston mikrobien ja niiden sisältämien geenien eli perintötekijöiden kokonaisuutta kutsutaan mikrobiomiksi. Mikrobiomin koko on valtava: sen kokonaisgeenimäärä on satoja tai jopa tuhansia kertoja suurempi kuin ihmisen kaikkien solujen perintötekijöiden määrä. Mikrobiomin voidaankin ajatella olevan ihmisen ulkoinen perintöaines, jonka tehtävä on kytkeä ympäristön vaikutukset elimistön puolustusjärjestelmään ja osaltaan tukea ihmisen rajapintojen toimintaa.

Mikrobiomi alkaa kehittyä lapsen syntyessä, ja se alkaa muistuttaa aikuisen normaalikasvustoa muutaman vuoden iässä. Mikrobit alkavat nopeasti asuttamaan ihmisen rajapintoja syntymisen yhteydessä, kun lapsi altistuu erilaisille mikrobeille synnytystavasta riippuen. Alatiesynnytyksessä lapsi altistuu äidin emättimen mikrobeille ja keisarileikkauksessa puolestaan aikuisten ihon mikrobeille. Normaalimikrobiston mikrobit tulevat elinympäristöstämme ja ravinnostamme. Mikrobiomin koostumus on jokaisella ihmisellä yksilöllinen. Siinä tapahtuu elämän aikana muutoksia, mutta muutokset ovat selkeästi pienempiä kuin erot eri ihmisten mikrobiomien välillä.

Mikrobiomin merkitys terveydelle

Terve mikrobiomi on monimuotoinen. Sen mikrobit rajoittavat toistensa kasvua, jolloin mikään yksittäinen mikrobi ei pääse lisääntymään taudinaiheuttajaksi. Mikrobiomi kouluttaa ihmiselimistön puolustusjärjestelmiä (immuniteetti) erottamaan vaaralliset tekijät vaarattomista ja omien solujemme tuotteet vieraista. Terveellä mikrobiomilla on kyky sietää stressiä ja palautua monimuotoiseksi häiriön, esimerkiksi antibioottikuurin, jälkeen. Jotta mikrobiomi pysyy terveenä ja monimuotoisena, tarvitsee se tasapainoisen elinympäristön ihmiskehossa. Ihmisen ihon ja limakalvojen fysiologinen tila ja puolustusjärjestelmän toiminta vaikuttavatkin mikrobiomin koostumukseen ja toimintaan.

Mikrobiomin monimuotoisuuden köyhtyminen altistaa sairauksille. Iholla elävien bakteerilajien runsaussuhteiden vinoutuessa ihottumaoireita aiheuttavat bakteerit, kuten Staphylococcus aureus, voivat päästä lisääntymään. Ihottuman hoito voi palauttaa ihon mikrobiomin monimuotoisuuden ennalleen. Esimerkiksi vauvoilla, joilla arvioitiin olevan kohonnut riski sairastua atooppiseen ekseemaan, kosteusvoiteiden päivittäinen käyttö kahden ensimmäisen elinkuukauden aikana lisäsi ihon mikrobiston monimuotoisuutta ja vähensi Streptococcus- ja Staphylococcus-lajien esiintyvyyttä.

Mikrobit ohjaavat puolustusjärjestelmän ja immuunivasteen kehittymistä. Monimuotoinen mikrobiomi tukee terveydelle tärkeän immuunitoleranssin eli sietokyvyn kehittymistä. Heikko immuunitoleranssi johtaa kohonneeseen riskiin kehittää voimakkaita tulehdusreaktioita keholle harmittomia rakenteita vastaan. Mikrobiomin toiminnalla katsotaan olevan merkitystä muun muassa allergioiden ja astman, tyypin 1 diabeteksen, tulehduksellisten suolistosairauksien ja liikalihavuuden synnyssä.

Terveen ja monimuotoisen normaalimikrobiston kehittymistä tukevat alatiesynnytys, rintaruokinta, vähärasvainen, vähäsokerinen ja kuitupitoinen ruokavalio, liikkuminen luonnossa ja ympäröivän luonnon monimuotoisuus. Kosketus luontoon on erityisen tärkeää ensimmäisten elinvuosien aikana, jolloin elimistön puolustusjärjestelmät kehittyvät voimakkaimmin. Tutkimukset ovat osoittaneet, että runsasmikrobinen, luonnollinen elinympäristö vaikuttaa suotuisasti sekä suoliston mikrobiston kokoonpanoon että allergioilta suojaavan immuunitoleranssin rakentumiseen.

Ihon normaalimikrobistoon kuuluvat mikrobit

Ihon mikrobiomin koostumukseen vaikuttavat ihoalueiden ominaisuudet, vanhemmilta saatu perimä, ikä, sukupuoli, BMI, erilaiset sairaudet ja lääkitykset. Lisäksi koostumukseen vaikuttavat elintavat, mukaan lukien ravinto, alkoholinkäyttö ja tupakointi, ulkoiset tekijät, kuten ihonhoito, kotieläimet sekä ulkoilu ja ympäröivän luonnon monimuotoisuus (kuva ).

Kuva

Ihon mikrobiomiin vaikuttavat tekijät. Ihon mikrobiomin koostumukseen vaikuttavat sekä ulkoiset että sisäiset tekijät.

Kuva: Nanna Fyhrquist ja Matilda Riskumäki, luotu BioRenderillä, https://BioRender.com

Ihon eri alueet eroavat toisistaan kosteuden, lämpötilan, happamuuden, karvatuppien määrän sekä tali- ja hikirauhasten määrän suhteen. Normaalimikrobisto on erilainen kosteissa varpaanväleissä ja kainaloissa kuin kuivalla iholla kyynärvarsissa ja pakaroissa tai talia erittävillä alueilla kasvoilla, selässä ja päänahassa. Ihon normaalimikrobiston koostumus myös muuttuu iän myötä. Suurin muutos tapahtuu murrosiässä, kun talineritys iholla vilkastuu.

Mikrobeja elää ihon pinnalla, syvemmälle ihoon työntyvissä karvatupeissa ja tali- ja hikirauhasissa sekä ihon syvemmissä kerroksissa. Ihon mikrobeista parhaiten tunnetaan bakteerit, sillä niiden osuus iholla on suurin, ja niitä on tutkittu eniten. Ihon sienistä ja etenkin viruksista ja arkeoneista tiedetään huomattavasti vähemmän.

Bakteerit

Ihon normaalimikrobistosta on tunnistettu seuraavat bakteerien pääsuvut: Cutibacterium, Staphylococcus ja Corynebacterium. Kasvojen talialueilla viihtyvät erityisesti Cutibacterium ja Staphylococcus, kosteilla taivealueilla, kuten kainaloissa, Corynebacerium ja Staphylococcus. Osa bakteerien alalajeista eli kannoista tunnetaan myös taudinaiheuttajina, jos niiden määrä pääsee kasvamaan suhteessa muihin bakteereihin, esimerkkinä Cutibacterium acnes aknessa ja Staphylococcus aureus atooppisessa ihottumassa ja karvatuppitulehduksessa.

Sienet

Ihon normaalimikrobiston sienet ovat pääosin Malassezia-lajien hiivoja, joita on talia erittävillä ihoalueilla, kuten kasvoilla, selässä ja päänahassa. Talihiivojen liiallinen lisääntyminen aiheuttaa savipuoli-ihottumaa ja tali-ihottuman oireiden pahenemista. Jaloissa sienien lajikirjo on monimuotoisempi kuin muualla kehossa. Niissä esiintyy Malassezia-lajien lisäksi esimerkiksi Aspergillus- ja Cryptococcus-sukujen lajeja.

Arkeonit

Iholla eläviä arkeoneja on suhteellisen vähän, ja niiden runsaus vaihtelee iän mukaan. Runsaimmillaan arkeoneja on iholla ennen murrosikää ja vanhemmalla iällä, jolloin talineritys on vähäistä. Ihon arkeonit ovat lähinnä Thaunarchaeota- ja Euryarchaeota-pääryhmien arkeoneja.

Talipunkit

Talipunkit eli karvatuppipunkit, Demodex folliculorum ja D. brevis, kuuluvat aikuisen normaaliflooraan. Ne elävät etenkin kulmakarvojen, ripsien ja nenän ihon karvatupissa. Ne lisääntyvät ruusufinnissä ja saattavat lisätä tulehdusreaktiota.

Virukset

Ihon normaalimikrobiston viruksiin kuuluu muun muassa papilloomaviruksen (human papilloma virus, HPV) ja herpesviruksen alatyyppejä sekä normaalimikrobiston bakteereja (esim. Cutibacterium acnesta) infektoivia viruksia, eli bakteriofageja. Bakteriofagit ovat runsain virusryhmä iholla, ja toiminnallaan ne vaikuttavat ihon bakteerilajien runsaussuhteisiin. Toisin kuin muut ihon mikrobit, virustyypit eivät ole sidoksissa eri ihoalueisiin, vaan niiden esiintyvyydessä on merkittäviä yksilöllisiä eroja.

Ihomikrobien merkitys ihon terveydelle

Ihomikrobit ovat sopeutuneet elämään ihon kuivassa, ravinneköyhässä ja hieman happamassa ja suolaisessa ympäristössä. Ihon epäsuotuisaan ympäristöön sopeutuneet mikrobit ylläpitävät toiminnallaan ihon terveyttä, ja niitä voidaan pitää aktiivisena osana ihon suojakerrosta. Ihon normaalimikrobiston mikrobit esimerkiksi estävät taudinaiheuttajien lisääntymistä iholla.

Valtaamalla elinalaa ja käyttämällä ihon vähäisiä ravinteita, ihomikrobit pienentävät taudinaiheuttajien mahdollisuuksia lisääntyä iholla. Jotkin mikrobilajit myös auttavat ylläpitämään ihon epäsuotuisaa ympäristöä. Cutibacterium acnes pilkkoo talirauhasten erittämää talia, ja sen sivutuotteena vapautuva rasvahappo tekee ihon pinnasta happaman.

Ihomikrobit aktivoivat ihosoluja tuottamaan antimikrobisia peptidejä, jotka tappavat mikrobeja. Myös ihomikrobit itse tuottavat antimikrobisia yhdisteitä estääkseen taudinaiheuttajien lisääntymistä. Eri stafylokokkilajit, kuten S. epidermidis ja S. hominis, tuottavat antimikrobisia yhdisteitä, jotka estävät S. aureus -lajin bakteerien liiallista lisääntymistä.

Ihomikrobit myös aktivoivat ihosolujen uusiutumisprosessia ja tukevat ihon läpäisyesteen toimintaa. Esimerkiksi S. epidermidis bakteeri tuottaa entsyymejä, jotka toimivat osana ihon soluvälien rakenneainetta, joka auttaa pitämään tunkeilijat kehon ulkopuolella. Haavan paranemisessa jotkin ihon normaalimikrobiston bakteerilajit aktivoivat paranemisprosessin alkuun vaadittavia puolustusjärjestelmän mekanismeja.

Mikrobit oireilevalla iholla

Ihon oireiluun liittyvät ihon fysiologisten ominaisuuksien ja geneettisten riskitekijöiden lisäksi muutokset normaalimikrobiston koostumuksessa. Oireilevalla iholla yksittäinen mikrobilaji, tai mikrobilajin kanta, on päässyt lisääntymään muiden lajien runsaussuhteiden kustannuksella. Tällaista vinoutunutta mikrobilajien runsaussuhdetta kutsutaan dysbioosiksi.

Usein ihosairauksiin liittyvät mikrobilajit kuuluvat ihon normaaliin mikrobistoon. Tällöin oireilun taustalla on monesti tietty mikrobikanta, jonka geneettiset ominaisuudet mahdollistavat infektion kehittymisen ja käynnistävät tai pahentavat ihon tulehdusreaktiota. Tautia aiheuttavien mikrobikantojen aktiivisuuteen voivat vaikuttaa muutokset ihon fysiologisissa ominaisuuksissa, kuten pH:ssa tai lipidikoostumuksessa. Ihosairauksien kliiniset oireet heijastavatkin usein ihon fysiologian, mikrobiomin koostumuksen ja immuunijärjestelmän toiminnan muutosten yhteisvaikutusta.

Atooppinen ihottuma ja Staphylococcus aureus

Useat eri tekijät altistavat atooppiselle ihottumalle, mukaan lukien ihon läpäisyesteen heikentyminen, johon vaikuttavat useat geneettiset riskitekijät, kuten orvaskeden filaggriini-valkuaisaineen geenimutaatio. Lisäksi ihon mikroympäristön muutokset, kuten ihon pH:n muutokset tai ravinteiden saatavuus, saattavat heikentää ihon läpäisyesteen toimintaa. Usein myös antimikrobisten peptidien tuotanto ihossa on normaalia heikompi atooppista ihottumaa sairastavilla. Nämä kaikki vaikuttavat ihon normaalimikrobiston koostumukseen.

Ihon normaalimikrobiston epätasapaino eli dysbioosi, jolle on ominaista hyödyllisten mikrobien määrän väheneminen ja Staphylococcus aureus -bakteerin lisääntyminen, on yleinen ilmiö atooppista ihottumaa sairastavilla. S. aureus tuottaa useita virulenssitekijöitä, kuten superantigeeneja ja alfa- ja deltatoksiineja, jotka eri mekanismien kautta aiheuttavat tulehdusta ja heikentävät ihon läpäisyestettä. Tämä puolestaan pahentaa atooppisen ihottuman oireita. Uusimpien tutkimusten mukaan lisääntynyt S. aureus -kolonisaatio tai -infektio liittyy tiettyihin atooppisen ekseeman alatyyppeihin eli endotyyppeihin, joille on tyypillistä vaikeampi ja paheneva tautimuoto.

Akne ja Cutibacterium acnes

Aknen puhkeamiseen liittyvät usein perinnölliset tekijät. Akneoireiden vakavuus on yhteydessä talinerityksen lisääntymiseen. Vilkastunut talineritys johtaa talia ravintonaan hyödyntävien mikrobien (esim. C. acnes) runsastumiseen talirauhasissa. Aknepotilailla iholla normaalisti elävän C. acnes -bakteerilajin runsastuminen johtaa talirauhasten tulehtumiseen.

Aknesta kärsivien iholla on todettu esiintyvän erilaisia C. acnes -lajin kantoja kuin terveillä yksilöillä. Nämä tulehdusta aiheuttavat kannat tuottavat virulenssitekijöitä, jotka saavat talirauhasissa aikaan tulehdusreaktion. Virulenssitekijöiden avulla C. acnes kiinnittyy talirauhasen kudoksiin tiukemmin ja hyödyntää talin lisäksi ihokudoksen proteiineja, mikä vaurioittaa kudosta.

Kirjallisuutta

  1. Oh J, Voigt AY. The human skin microbiome: from metagenomes to therapeutics. Nat Rev Microbiol 2025. doi: 10.1038/s41579-025-01211-9. Online ahead of print.
  2. Scharschmidt TC, Segre JA. Skin microbiome and dermatologic disorders. J Clin Invest 2025;135(3):e184315.
  3. Harder I, Stölzl D, Sander N, ym. Effects of early emollient use in children at high risk of atopic dermatitis: a German pilot study. Acta Derm Venereol 2023;103:adv5671.
  4. Moitinho-Silva L, Boraczynski N, Emmert H, ym. Host traits, lifestyle and environment are associated with human skin bacteria. Br J Dermatol 2021;185(3):573–84.
  5. Ottman N, Ruokolainen L, Suomalainen A, ym. Soil exposure modifies the gut microbiota and supports immune tolerance in a mouse model. J Allergy Clin Immunol 2019;143(3):1198–206.e12.
  6. Byrd AL, Belkaid Y, Segre JA. The human skin microbiome. Nat Rev Microbiol 2018;16(3):143–55.
  7. Amon P, Sanderson I. What is the microbiome? Arch Dis Child Educ Pract Ed 2017;102(5):257–60.
  8. Haahtela T, Hanski I, von Hertzen L, ym. Luontoaskel tarttumattomien tulehdustautien torjumiseksi. Duodecim 2017;133(1);19–26.
  9. Liu J, Yan R, Zhong Q, ym. The diversity and host interactions of Propionibacterium acnes bacteriophages on human skin. ISME J 2015;9(9):2078–93.
  10. Meri S, de Vos W. Suoliston mikrobit hyvässä ja pahassa - 130 vuotta Theodor Escherichin jälkeen. Duodecim 2015;131(22):2091–8.
  11. Lauerma A, Salava A. Mikrobiomi – ihon uusi toimija. Duodecim 2014;130(6):613–4.
  12. Huffnagle GB, Noverr MC. The emerging world of the fungal microbiome. Trends Microbiol 2013;21(7):334–41.
  13. Salonen A. Ihmisen mikrobiomit. Duodecim 2013;129(22):2341–8.
  14. Jalava J. Ihminen ja mikrobisto – vanha kumppanuus uudessa tarkastelussa. Suom Lääkäril 2010;65(11):1005–11.